Организовано в 1987 году на базе 2-клиники Самаркандского Медицинского Института. Отделение оказывает специализированную хирургическую помощь больным г. Самарканда, районов Самаркандской области, а также детскому населению соседних областей - Джизакской, Кашкадарьинской, Сурхандарьинской, Навоийской, Бухарской, Хорезмской и Республики Каракалпакстан.
Ежегодно в отделении проводится около 7000 различных по сложности операций.
В отделение проводятся высокотехнологические оперативные вмешательства: эндоурологические, лапароскопические, торакоскопические, видеобронхоскопические операции.
Сотрудники отделения детской урологии:
Заведующий отделением – Курбанов Суннатилло Хаминович 1972 г.р., окончил СамМИ в 1996 году, с 1996 по 1997 проходил интернатуру в 2-клинике СамМИ. С 2020 года является заведующим операционного отделения. Является председателем профсоюзного комитета 2-клиники СамМИ.
Старшая медсестра - Матякубова Шахноза 1997 года рождения, окончила мед.колледж в 2015 г. С 2018 года является старшей-медсестрой отделения.